ДОСЛІДЖЕННЯ ПРОФІЛЮ БІОЛОГІЧНОЇ АКТИВНОСТІ ПОХІДНИХ 2-МЕТИЛХІНОЛІН-4-ТІОЛІВ МЕТОДАМИ ХЕМОІНФОРМАТИКИ
Ключові слова:
2-метилхінолін-4-тіол, хемоінформатика, показники біологічної активності
Анотація
У статті подано результати аналізу похідних 2-метилхінолін-4-тіолу методами хемоінформатики. Основними завданнями дослідження є розрахунок, систематизація та аналіз отриманого масиву даних, які співвідносяться із різними біологічними ефектами. Результати були отримані шляхом in silico розрахунків SAR кореляцій для подальшого раціонального дизайну лікарських препаратів, разом із проведенням молекулярного докінгу по відношенню до обраного ензиму SOD1.
Визначено залежності «структура-активність» щодо вірогідного впливу фізико-хімічних та структурних особливостей досліджуваних сполук на їхню біологічну активність. Визначено найбільш потенційно вірогідні сайти зв’язування для досліджуваних сполук із ферментом SOD1.
Посилання
ЛІТЕРАТУРА
1. Бражко О. А. Біологічно активні похідні хіноліну та акридину з азото- та сірковмісними функціональними групами: дис. доктора біол. наук: спец. 02.00.10 ‒ «Біоорганічна хімія» / Бражко Олександр Анатолійович. – К., 2005. – 456 с.
2. Бражко О. А. Дослідження антимікробної дії 2-тіопохідних хіноліну / О. А. Бражко // Актуальні питання фарм. та мед. науки і практики. – Запоріжжя, 1999. − Вип. 4. − С. 23‒26.
3. Бражко A. А. Синтез, свойства и биологическая активность 2-тио- и 4-тио,
2-гидразино- и 4-гидразинохинолинов и их производных: автореф. дис. на соискание науч. звания к.ф.н.: спец. 15.00.02 ‒ «Фармацевтическая химия и фармакогнозия» / А. А. Бражко. – Львов, 1989. – 20 с.
4. Gaikwad J. V. Application of chemoinformatics for innovative drug discovery / J. V. Gaikwad // International Journal of Chemical Sciences and Applications. – 2010. – Vol. 1. – P. 16‒24.
5. Pettersen E. F. UCSF Chimera – A Visualization System for Exploratory Research and Analysis / E. F. Pettersen, T. D. Goddard // J. Comput. Chem. – 2004. – Vol. 25. – P. 1605‒1612.
6. Martin T.M. Toxicity Estimation Software Tool (TEST) / T. M. Martin // U. S. Environmental Protection Agency: Washington DC, 2016.
7. Trott O. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading / O. Trott, J. Olson // Journal of Computational Chemistry. – 2010. – Vol. 31. – P. 455-461.
8. Tetko I. V. Virtual computational chemistry laboratory – design and description / I. V. Tetko, J. Gasteiger // J. Comput. Aid. Mol. Des. – 2005. – Vol. 19. – P. 453‒463.
9. Case D.A. AMBER 2016 / D.A. Case, R.M. Betz // University of California : San Francisco, 2016.
10. Abolghasem J. Experimental and Computational Methods Pertaining to Drug Solubility / J. Abolghasem, A. F. Mohammad // Toxicity and Drug Testing. – 2012. – P. 187‒218.
REFERENCE
1. Brazhko O. A. Bіologіchno aktivnі pohіdnі hіnolіnu ta akridinu z azoto- ta sіrkovmіsnimi funkcіonal'nimi grupami: dis. doktora bіol. nauk: spec. 02.00.10 ‒ «Bіoorganіchna hіmіja» / Brazhko Oleksandr Anatolіjovich. – K., 2005. – 456 s.
2. Brazhko O. A. Doslіdzhennja antimіkrobnoyi dіyi 2-tіopohіdnih hіnolіnu / O.A. Brazhko // Aktual'nі pitannja farm. ta med. nauki і praktiki. – Zaporіzhzhja, 1999. − Vip. 4. − S. 23‒26.
3. Brazhko A. A. Sintez, svojstva i biologicheskaja aktivnost' 2-tio- i 4-tio, 2-gidrazino- i 4-gidrazinohinolinov i ih proizvodnyh: avtoref. dis. na soiskanie k.f.n.: spec. 15.00.02 ‒ «Farmacevtichna hіmіja ta farmakognozіja» / A. A. Brazhko. – L'vov, 1989. – 20 s.
4. Gaikwad J. V. Application of chemoinformatics for innovative drug discovery / J. V. Gaikwad // International Journal of Chemical Sciences and Applications. – 2010. – Vol. 1. – P. 16‒24.
5. Pettersen E. F. UCSF Chimera ‒ A Visualization System for Exploratory Research and Analysis / E. F. Pettersen, T. D. Goddard // J. Comput. Chem. – 2004. – Vol. 25. – P. 1605‒1612.
6. Martin T.M. Toxicity Estimation Software Tool (TEST) / T.M. Martin // U.S. Environmental Protection Agency: Washington DC, 2016.
7. Trott O. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading / O. Trott, J. Olson // Journal of Computational Chemistry. – 2010. – Vol. 31. – P. 455‒461.
8. Tetko I. V. Virtual computational chemistry laboratory ‒ design and description / I. V. Tetko, J. Gasteiger // J. Comput. Aid. Mol. Des. – 2005. – Vol. 19. – P. 453‒463.
9. Case D. A. AMBER 2016 / D. A. Case, R.M. Betz // University of California: San Francisco, 2016.
10. Abolghasem J. Experimental and Computational Methods Pertaining to Drug Solubility / J. Abolghasem, A. F. Mohammad // Toxicity and Drug Testing. – 2012. – P. 187‒218.
1. Бражко О. А. Біологічно активні похідні хіноліну та акридину з азото- та сірковмісними функціональними групами: дис. доктора біол. наук: спец. 02.00.10 ‒ «Біоорганічна хімія» / Бражко Олександр Анатолійович. – К., 2005. – 456 с.
2. Бражко О. А. Дослідження антимікробної дії 2-тіопохідних хіноліну / О. А. Бражко // Актуальні питання фарм. та мед. науки і практики. – Запоріжжя, 1999. − Вип. 4. − С. 23‒26.
3. Бражко A. А. Синтез, свойства и биологическая активность 2-тио- и 4-тио,
2-гидразино- и 4-гидразинохинолинов и их производных: автореф. дис. на соискание науч. звания к.ф.н.: спец. 15.00.02 ‒ «Фармацевтическая химия и фармакогнозия» / А. А. Бражко. – Львов, 1989. – 20 с.
4. Gaikwad J. V. Application of chemoinformatics for innovative drug discovery / J. V. Gaikwad // International Journal of Chemical Sciences and Applications. – 2010. – Vol. 1. – P. 16‒24.
5. Pettersen E. F. UCSF Chimera – A Visualization System for Exploratory Research and Analysis / E. F. Pettersen, T. D. Goddard // J. Comput. Chem. – 2004. – Vol. 25. – P. 1605‒1612.
6. Martin T.M. Toxicity Estimation Software Tool (TEST) / T. M. Martin // U. S. Environmental Protection Agency: Washington DC, 2016.
7. Trott O. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading / O. Trott, J. Olson // Journal of Computational Chemistry. – 2010. – Vol. 31. – P. 455-461.
8. Tetko I. V. Virtual computational chemistry laboratory – design and description / I. V. Tetko, J. Gasteiger // J. Comput. Aid. Mol. Des. – 2005. – Vol. 19. – P. 453‒463.
9. Case D.A. AMBER 2016 / D.A. Case, R.M. Betz // University of California : San Francisco, 2016.
10. Abolghasem J. Experimental and Computational Methods Pertaining to Drug Solubility / J. Abolghasem, A. F. Mohammad // Toxicity and Drug Testing. – 2012. – P. 187‒218.
REFERENCE
1. Brazhko O. A. Bіologіchno aktivnі pohіdnі hіnolіnu ta akridinu z azoto- ta sіrkovmіsnimi funkcіonal'nimi grupami: dis. doktora bіol. nauk: spec. 02.00.10 ‒ «Bіoorganіchna hіmіja» / Brazhko Oleksandr Anatolіjovich. – K., 2005. – 456 s.
2. Brazhko O. A. Doslіdzhennja antimіkrobnoyi dіyi 2-tіopohіdnih hіnolіnu / O.A. Brazhko // Aktual'nі pitannja farm. ta med. nauki і praktiki. – Zaporіzhzhja, 1999. − Vip. 4. − S. 23‒26.
3. Brazhko A. A. Sintez, svojstva i biologicheskaja aktivnost' 2-tio- i 4-tio, 2-gidrazino- i 4-gidrazinohinolinov i ih proizvodnyh: avtoref. dis. na soiskanie k.f.n.: spec. 15.00.02 ‒ «Farmacevtichna hіmіja ta farmakognozіja» / A. A. Brazhko. – L'vov, 1989. – 20 s.
4. Gaikwad J. V. Application of chemoinformatics for innovative drug discovery / J. V. Gaikwad // International Journal of Chemical Sciences and Applications. – 2010. – Vol. 1. – P. 16‒24.
5. Pettersen E. F. UCSF Chimera ‒ A Visualization System for Exploratory Research and Analysis / E. F. Pettersen, T. D. Goddard // J. Comput. Chem. – 2004. – Vol. 25. – P. 1605‒1612.
6. Martin T.M. Toxicity Estimation Software Tool (TEST) / T.M. Martin // U.S. Environmental Protection Agency: Washington DC, 2016.
7. Trott O. AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading / O. Trott, J. Olson // Journal of Computational Chemistry. – 2010. – Vol. 31. – P. 455‒461.
8. Tetko I. V. Virtual computational chemistry laboratory ‒ design and description / I. V. Tetko, J. Gasteiger // J. Comput. Aid. Mol. Des. – 2005. – Vol. 19. – P. 453‒463.
9. Case D. A. AMBER 2016 / D. A. Case, R.M. Betz // University of California: San Francisco, 2016.
10. Abolghasem J. Experimental and Computational Methods Pertaining to Drug Solubility / J. Abolghasem, A. F. Mohammad // Toxicity and Drug Testing. – 2012. – P. 187‒218.
Як цитувати
Завгородній, М. П., Веселков, А. В., Бражко, О. А., & Завгородній, В. М. (1). ДОСЛІДЖЕННЯ ПРОФІЛЮ БІОЛОГІЧНОЇ АКТИВНОСТІ ПОХІДНИХ 2-МЕТИЛХІНОЛІН-4-ТІОЛІВ МЕТОДАМИ ХЕМОІНФОРМАТИКИ. Acta Biologica Ukrainica, (1), 201-208. вилучено із http://journalsofznu.zp.ua/index.php/biology/article/view/80
Розділ
БІООРГАНІЧНА ХІМІЯ ТА БАР
ISSN 
